La escuela comenzó a brindar servicios en agosto de 1997 a cargo del Prof. Pedro García Palma, mismo que inició el desarrollo de las actividades de enseñanza-aprendizaje en dos edificios construidos por pobladores de San Fernando, que tenían como función inicial una carpintería y el molino de la comunidad.
Un total de 17 jóvenes de diferentes edades, entusiasmados y con la intención de continuar con su formación académica, serían la primera generación 1997–2000, pues en ese tiempo, el nivel máximo de estudios de la comunidad, era la educación primaria.
En San Fernando se cuenta con los servicios básicos de supervivencia, como energía eléctrica, agua potable, calles pavimentadas, servicios de salud y señal telefónica. Cuenta también con los tres niveles educativos de la educación básica obligatoria: Preescolar, Primaria y Secundaria; lo que permite a los jóvenes mejorar su calidad de vida y aspirar a otras oportunidades de desarrollo. Cada vez más jóvenes egresados de nuestra escuela, continúan sus estudios de bachillerato en comunidades cercanas.
Durante el periodo 1997–1998, el Prof. Pedro García Palma junto con la sociedad de padres de familia, lograron oficialmente la donación del terreno para la construcción de las instalaciones de la escuela.
En el año 2000–2001, la sociedad de padres de familia gestionó ante el presidente municipal en turno, Fernando González Izquierdo, recursos para cercar el área perimetral de la escuela, se construyó también la primera aula y los baños para alumnos y el personal docente docente.
En el año 2003, el Prof. Pedro García Palma dejó el cargo de director responsable al Prof. Christian García García, mismo que durante su administración lograría a través de diversos programas la construcción de 2 aulas más.
En los ciclos escolares posteriores, los directivos encargados de la escuela, hicieron también gestiones de mejora en la infraestructura, como el caso puntual del Prof. Carlos Luis Elizalde López, que logró la construcción de nuevos sanitarios para uso dl alumnado n el ciclo escolar 2014-2015.
En agosto de 2018, se le asignó al Mtro. Santiago Basilio Lagunas el cargo de responsable de la dirección con grupo; y continuando con la labor de directores anteriores, la de mejorar los espacios educativos de la escuela, en enero de 2019 gestionó y logró la construcción de la barda perimetral.
En 2022, con apoyo de la sociedad de padres de familia y recursos de la tienda escolar, se construyó un espacio techado para uso del comedor escolar; un espacio en el que los alumnos conviven y comparten sus alimentos.
