Está institución tiene su origen junto con el sistema de telesecundaria; el cual se remonta hasta el año 1968. El subsistema de telesecundaria debe su creación principalmente a las zonas que no tenían una secundaria general o técnica, la comunidad de Atlautla no contaba con el servicio de educación secundaria y por ello el patronato de San Miguel Atlautla gestiono la creación de una escuela telesecundaria surgiendo un grupo multigrado con una matricula total de 18 alumnos los cuales eran atendidos en el edificio de la iglesia de la misma comunidad. Egresando la primera generación en el año de 1971 con tan solo 4 alumnos; las razones que el sistema de telesecundaria surge como un paliativo para aquellos alumnos que no prosiguieron sus estudios inmediatamente.
La escuela telesecundaria estuvo brindando servicio durante 12 años en el edificio de la iglesia, al irse incrementando la matricula los padres de familia gestionaron un espacio más amplio para trabajar y como respuesta el ayuntamiento brindo el antiguo edifico de la presidencia municipal en la Corregidora e independencia en el Barrio San Jacinto bajo la dirección del profesor Luis Norberto Aguilar
Álvarez junto con los profesores Lucila Floriberta Galicia López, German Aguilar Olvera, Alfredo Cervantes Sosa contando con una matrícula de 40 alumnos. En este espacio se laboró durante una década aproximadamente.
Para el año 1984 se nombró al profesor eugenio Barrera Benítez como el responsable de la dirección de la escuela telesecundaria
“Margarita Maza de Juárez” quien encabezaba a padres y maestros en varias manifestaciones realizadas en Palacio de Gobierno de Toluca para solicitar la construcción de aulas viendo coronado el esfuerzo en el año de 1988 cuando se construyeron 2 aulas (preconstruidas) en el terreno propio de la institución donado por los comuneros de la cabecera municipal, como esto era insuficiente para la matricula con que contaba la institución las manifestaciones prosiguieron y para 1990 el Gobierno del Estado autoriza la construcción de 3 aulas preconstruidas. Es en este momento cuando los padres de familia junto con los docentes deciden a ocupar las instalaciones construidas por el gobierno del estado, lo que hizo que descubrieran que era necesario la construcción la barda perimetral del exterior del lado de la carretera para salvaguardar la integridad y seguridad de los alumnos.
A continuación, se presenta una amistad con el señor Trinidad Ramírez Baz el cual era un funcionario público de la comunidad de Ozumba y se le solicitaron los materiales necesarios para la construcción de 5 aulas (varilla, cemento, calidra y block) y el material complementario (arena, graba, piedra y mano de obra) la proporciono la comunidad de Atlautla.
Corriendo el año 2003 las autoridades del Estado bardean la institución del lado de la barranca y del lado de la primaria. En el año 2006 el C. Ángel Marín Barragán quien fungiera como presidente municipal construyo lo que actualmente es la dirección. En el año 2007 la sociedad de padres de familia vio la necesidad de bardear del lado poniente para evitar la sustracción de materiales varios.
En el 2010 por gestión del C. Raúl Navarro Rivera presidente municipal de Atlautla gestiona ante el gobierno estatal la construcción del aula de usos múltiples, no dándole tiempo de realizar la obra, asume el gobierno municipal la C. María del Carmen Carreño García quien concluye y entrega dicha obra.
Para el año 2012 ante el gran aumento de la matrícula escolar se solicitó a la presidencia municipal la construcción de unos baños dignos de la institución. En este mismo año en conjunto con la asociación de padres de familia se construyeron 2 aulas en la parte superior del lado poniente los cuales fungirían como sala de cómputo y biblioteca, misma que fueron dañadas en su totalidad por el sismo del año 2017, estas son demolidas en el 2018 y comienzan a reedificarse en el 2019 por el INIFED que hasta la fecha están inconclusas.
En el periodo que abarca del año 2014-2018 la institución no decayó en su combatividad y logro ser incluida en varios programas y proyectos federales como Escuelas de Calidad, Proyecto de Reforma Educativa y Rezago Escolar lo que beneficio a la escuela con cambios piso a loseta en todas las aulas, laboratorio y dirección escolar, así como también herrería, puertas, computadoras, bocinas, proyectores, grabadoras, equipo de audio, reparación de paneles de las 5 aulas prefabricadas y la reestructuración total del laboratorio de ciencias.
En el 2016 la escuela se vio beneficiada con la techumbre de la cancha de usos múltiples.
