La escuela comenzó a brindar servicios en 1969, en casa del Sr. Manuel Cruz Blanca Tabaco, ubicada en la calle Miguel Hidalgo, esquina con José María Morelos del centro de la comunidad. Desempeñó primero el cargo de directora la profesora Mireya Sánchez Acosta, y la primera generación que egresó fue de 16 alumnos (diez hombres y seis mujeres).
Por la demanda escolar que se presentaba año con año, la escuela creció notablemente y, con ayuda del presidente municipal de Almoloya de Juárez en ese tiempo, el C. Lic. Venancio Consuelo Castillo, el Sr. Juan Consuelo Cuarenta, Presidente de la Junta de Colaboración Ciudadana y la comunidad en general, se adquirió el terreno que ocupó nuestro plantel hasta el año 2012.
Inicialmente, los trabajos de construcción del inmueble fueron coordinados por el delegado en turno, terminándose siete aulas; una de ellas se destinó como laboratorio y la otra como dirección escolar, además de los sanitarios. A este plantel se le conocía con el nombre de Dr. Jorge Jiménez Cantú (político y médico mexicano, quien fuera Gobernador del Estado de México entre 1975 y 1981), y al obtener su registro definitivo le asignaron el de Agustín Yañez (novelista, ensayista, cuentista y político mexicano nacido en Jalisco a principios del siglo XX).
Con el paso del tiempo y de acuerdo a las necesidades de la institución, la sociedad de padres de familia adaptó como aulas los espacios restantes de terreno, y aunque no contaban con las dimensiones y reglas de seguridad requeridas, las remodelaron para que funcionaran mejor. Para el año 2004 se gestionó la construcción de dos aulas más con ayuda del Lic. Luis Guadarrama Colín,Regidor de Almoloya de Juárez.
En el año 2007, la Profa. Enriqueta Rodríguez Ordóñez, directora de la escuela en ese entonces, fue ascendida como supervisora y asignan como responsable de la misma al Prof. Ismael Lara Valdez, quien retoma las gestiones para seguir con la construcción de un nuevo edificio.
Fue hasta el año 2011 cuando el Instituto Mexiquense para la Infraestructura Física Educativa (IMIFE) y la empresa de materiales EMO, realizaron los estudios del suelo de un terreno ubicado en la calle Chapultepec s/n, donado por la comunidad a los Servicios Educativos Integrados al Estado de México (SEIEM), iniciando los trabajos de construcción en octubre de ese mismo año, derivado de los proyectos de inversión del Departamento de Instalaciones Educativas de los SEIEM. El nuevo edificio fue entregado por la empresa en marzo de 2012, y en ese mismo año se trasladó todo el personal docente y alumnos para ser ocupado.
En el ciclo escolar 2015-2016 se contaba con una matrícula de 345 alumnos.