La historia de esta escuela comienza en la década de los noventa, se gestionó en varias ocasiones una escuela secundaria ante el gobierno del estado y no se tuvo éxito.
Posteriormente, en 1999 se solicitó a Servicios Educativos Integrados al Estado de México (SEIEM) una escuela secundaria técnica que cubriera la demanda de alumnos egresados de la primaria. En ese mismo año el C. Prof. Julián Martínez Rocha, Secretario de Trabajos y Conflictos de Educación Indígena del Sindicato Nacional de los Trabajadores de la Educación (SNTE), brindó el apoyo en coordinación con el Prof. Lorenzo Zariñana Rivera, Secretario de Trabajo y conflictos de Escuelas Secundarias Técnicas.
Las autoridades municipales y ejidales invitaron a los profesores Roberto González Reyes y Eleuterio Martínez Rocha originarios de la misma comunidad, para colaborar en este proyecto, mismos que laboraban como docentes en educación indígena.
Estas personas acudieron a las oficinas de SEIEM para conocer la respuesta a la petición planteada. Fueron recibidos por el profesor Julián Martínez Rocha, el cual les informó satisfactoriamente y les informó sobre los requisitos que se habrían de cumplir, como es el número de alumnos y las características del terreno. En consecuencia, las personas interesadas en el proyecto se dieron a la tarea de invitar a todos los alumnos en edad escolar para que se inscribieran. Había quienes no creían en la posibilidad de tener una escuela secundaria y poco caso hacían a los planteamientos de los docentes y las autoridades.
El C. Prof. Juan Miguel Herrera Ocomatl que en esa época era supervisor escolar de la Zona, visitó la comunidad para analizar lo que sucedía acompañado del profesor Gregorio Rebollar Vilchis. La finalidad de esta visita era para dar credibilidad a todo lo que anteriormente se les había informado, la creación de una escuela secundaria técnica era realidad.
De los 60 alumnos que se tenían que inscribir como requisito se reunieron 55, pero el profesor Gregorio Rebollar Vilchis acudió a la escuela primaria para invitar de nuevo a los jóvenes que iban a terminar sus estudios para cubrir los 5 que faltaban.
Ya reunida la cantidad de alumnos se tuvo contacto con personal de los SEIEM los cuales notificaron la visita del C. Prof. Juan Aguilar Villa, Jefe del Departamento de Escuelas Secundarias Técnicas en el Valle de Toluca y de los profesores Lorenzo Zariñana Rivera, Secretario de Trabajo y conflictos del SNTE y Julián Martínez Rocha, Secretario de Trabajos y Conflictos de Educación Indígena, así como las autoridades del Municipio de San Felipe del Progreso para formalizar la fundación de la escuela.
Llegó el día esperado, las autoridades educativas se comprometieron a asignar los docentes necesarios para cubrir la demanda educativa y pasaron lista a los alumnos inscritos. Los profesores que iniciaron con los trabajos de la escuela fueron: Gregorio Rebollar Vilchis como director de la Escuela, Raúl Ángeles Máximo en la asignatura de Matemáticas, Minerva Atenea López Bernal en español, Juan Ángel Cruz Espinosa en Educación Física y Juan Monroy Vilchis en Secretariado.
Las autoridades de la localidad platicaron con el Prof. José Remedios Preciado, Director de la Escuela Primaria “Lázaro Cárdenas” para que facilitara dos aulas mientras se construían las instalaciones de la secundaria. Fue así como en 1999 comenzó a brindar servicios educativos a la comunidad.