Iniciaron las actividades de la escuela en agosto de 1987 en casas de particulares,por inquietud de un grupo de padres de familia encabezados por el Profesor Pedro Flores de la Torre, Supervisor Escolar de la entonces Zona VIII, mismo que comisionó al Profesor Fernando Andarlo García, docente de la Escuela Secundaria Técnica 46, para que se responsabilizara del naciente plantel.
El personal fundador de la escuela es el siguiente: Profesor Pedro Flores de la Torre, Supervisor de la Zona Escolar VIII; Profesor Fernando Andario García, responsable comisionado para el inicio de actividades;Profesor Víctor Mendoza Velázquez, responsable de Español;Profesora Irma Reyes de Ciencias Naturales; Profesora María de Jesús Méndez Romo de Ciencias Sociales; y Profesor José Antonio Linares Montaño, de Educación Artística.
En octubre del mismo año asume el cargo de directora la profesora Margarita Lemus Gómez, misma que lo desempeñara hasta octubre del año 2001.
En octubre de 1998 se hizo la entrega oficial de la primera etapa de las instalaciones de la escuela, en el terreno donado por los ejidatarios de la comunidad de Xico, las cuales integraban 4 aulas, 2 talleres, laboratorio, cooperativa escolar (espacio ocupado como oficina), sanitarios e intendencia.
En la segunda etapa de construcción (octubre de 1989) se terminaron 6 aulas de ciencias y la cancha de basquetbol; en marzo de 1991 se otorgó el nombre que llevaría la escuela, en honor al literato jalisciense “Juan Rulfo”; de 1996 a 2000 se instaló de forma provisional la Unidad Académica Chalco, de la Universidad Autónoma del Estado de México (UAEM); en junio del 2000 la escuela sufrió graves daños debido a la inundación de aguas negras, ocasionados por el desborde del río La Compañía; siniestro que provocó pérdidas de mobiliario y equipo, de los cuales, el gobierno del estado solo cubrió una pequeña parte.
El Profesor Adrián García Aguilar retomó las obras de reconstrucción del plantel con recursos de la cooperativa escolar y sociedad de padres de familia, una vez que lo asignaron como director en noviembre de 2001, y ante la omisión de las autoridades correspondientes para otorgar el apoyo gestionado.
De septiembre de 2004 al 28 de febrero de 2014, se brindó apoyo al Colegio de Estudios Científicos y Tecnológicos del Estado de México (CECyTEM) Valle de Chalco II, para que ocupara las instalaciones de la escuela.
Una segunda inundación causada nuevamente por aguas negras del río La Compañía en febrero de 2010, dañó gravemente el equipo y mobiliario; el nivel del agua alcanzó 2 metros de altura y las pérdidas fueron más numerosas comparadas con la primera vez.
De marzo de 2010 a mayo de 2011 se llevaron a cabo un sinnúmero de acciones como reparaciones, arreglos de mobiliario y equipo; con el propósito de rescatar la funcionalidad del plantel. Actualmente seguimos gestionando y visitando las instancias que nos puedan apoyar y recuperar lo perdido.
